热带鱼的杂交，有些种类的热带观赏鱼容易发生突变，比如鳍大变形，颜色和花纹斑点变化增加，有些突变产生白化种或全黑后代。有些鱼也容易杂交，同一属不同种鱼之间杂交，亲缘关系比较近，杂交育种容易成功。比如剑鱼和月鱼容易杂交，三色鱼和牡丹鱼容易杂交，可以产生与亲本不同的后代。
不同科属鱼类间的杂交具有亲缘关系长、杂交繁殖难度大、技术性强的特点。无论是鱼类的自繁变异还是不同物种的杂交，并不是100%的后代都是理想的、不稳定的。经过几代人工优化和定向培育，其变异或杂交产生的后代的颜色、图案和形态特征可以稳定下来。今后要防止与原物种近亲繁殖或回交，以免发生不良变异或返祖现象。为了新的更美丽的变异物种。应该有选择地确定特征和性别，然后进行匹配和记录。
一般家庭养殖热带鱼进行杂交繁殖，利用容易杂交的物种，或者与同属变异的后代杂交，可以产生与亲本颜色不同的后代。现在，例如，如果雌性金头神仙鱼与雄性黑色神仙鱼配对，就可以繁殖和生产黑色头部神仙鱼。当然，并不是所有的后代都是理想的，所以他们应该被筛选，保持纯洁并被丢弃。因为神仙鱼有选择自己配偶的习惯，如何将这两种不同肤色的神仙鱼配对，组合在一起生孩子呢？我们可以培养感情，让雌性金头神仙鱼和雄性黑神仙鱼可以长时间保持在一起，互相适应，互相吸引。一段时间后，雄鱼会逐渐靠近雌鱼，然后一起游动觅食，说明配对成功。当雌雄亲鱼腹部凸出小管状肛突时，很快就会分娩，然后放入卵床(有卵等需要，同神仙鱼)。
